VCF в 23andMe
Конвертируйте генетический VCF файл в 23andMe формат.
или перетащите файл сюда
Конвертируйте генетический VCF файл в 23andMe формат.
или перетащите файл сюда
VCF — это стандартный формат хранения генетических данных, часто используемый в биоинформатике и медицинских исследованиях. Однако он не всегда совместим с популярными сервисами анализа ДНК. Например, Genotek позволяет скачивать исходные генетические данные в формате VCF.
Формат 23andMe принимают GEDmatch, Genomelink, Genetic Genie, Living DNA, tellmeGen и другие сервисы — смотрите каталог на главной. FamilyTreeDNA принимает только оригинальные файлы.
Да. Файл обрабатывается прямо в вашем браузере, на вашем устройстве: он не отправляется на наш сервер и никому не передаётся. После закрытия вкладки ничего не сохраняется.
Файлы полногеномного или экзомного секвенирования, например от Genotek, Dante Labs или Nebula, в виде .vcf или .vcf.gz (включая bgzip). В колонке ID должны быть rsID. Лучше всего подходит сборка генома GRCh37 (hg19).
Формат 23andMe — это набор позиций чипа 23andMe. Сервисы анализа работают именно с ними, поэтому в результат попадают только эти SNP.
Полногеномный VCF обычно содержит только отличия от референсного генома, поэтому отсутствующая позиция означает совпадение с референсом. Для экзома и неполных VCF это допущение: позиции вне покрытия тоже будут записаны как референсные.
GEDmatch и Genomelink принимают файлы в формате 23andMe. FamilyTreeDNA принимает только оригинальные файлы тестировщиков, сконвертированный VCF туда не подойдёт.
Обычно несколько секунд. Большой полногеномный VCF может обрабатываться до пары минут — это зависит от скорости вашего устройства.